Lapsia voidaan kuvata magneettitutkimuksella, kuten aikuisiakin. Pienten lasten osalta tulisi kuitenkin huomioida, että tutkimustilanteessa kuvattava kohde tulisi olla paikallaan. Tällöin magneettitutkimus voidaan tehdä sairaalassaolosuhteissa siten, että lapsi on nukutettu tai hän on saanut rauhoittavan lääkityksen. Kouluikäiset lapset pystyvät yleensä jo olemaan hyvin paikallaan tutkimuksen ajan.
