Magneettitutkimuksessa käytetty varjoaine on paremmin siedetty kuin röntgentutkimusten varjoaine. Varjoaineen käyttöön liittyy kuitenkin aina pieni munuaiskomplikaation riski. Tämä on ongelma lähinnä munuaisen vajaatoimintaa sairastavilla potilailla.