Magneettitutkimuksen kesto riippuu kuvattavasta kohteesta ja mitä tietoa kuvattavasta kohteesta halutaan saada. Tyypillisesti kuvaus kestää 10–20 minuuttia. Lisäksi tehdään esivalmisteluja. Yhteensä magneettikuvaukseen on hyvä varata 30–60 minuuttia.